Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06324 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06324 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06324 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06324 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06324 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06324 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06324 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms