Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms