Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tgfb1P04202 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tgfb1P04202 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tgfb1P04202 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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