Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms