Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc1P02468 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms