Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Ab1P01921 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Ab1P01921 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Ab1P01921 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Ab1P01921 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-Ab1P01921 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-Ab1P01921 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms