Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01680 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01680 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01680 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01680 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01680 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01680 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01680 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01680 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01680 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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