Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01678 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01678 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01678 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01678 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01678 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01678 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01678 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01678 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01678 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms