Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01668 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01668 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01668 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01668 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01668 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms