Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01648 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01648 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01648 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01648 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms