Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01641 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01641 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01641 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01641 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01641 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01641 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms