Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01636 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01636 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01636 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01636 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01636 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms