Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms