Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MscO88940 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MscO88940 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MscO88940 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MscO88940 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms