Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cd160O88875 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cd160O88875 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cd160O88875 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cd160O88875 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd160O88875 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cd160O88875 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms