Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CcnkO88874 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CcnkO88874 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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