Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Orc4O88708 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Orc4O88708 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms