Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BlmO88700 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BlmO88700 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BlmO88700 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BlmO88700 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BlmO88700 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BlmO88700 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BlmO88700 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BlmO88700 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BlmO88700 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BlmO88700 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BlmO88700 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BlmO88700 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms