Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClppO88696 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClppO88696 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClppO88696 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClppO88696 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms