Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dll3O88516 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms