Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SfnO70456 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SfnO70456 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SfnO70456 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SfnO70456 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SfnO70456 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms