Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lnx1O70263 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms