Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RngttO55236 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RngttO55236 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms