Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms