Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms