Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg2O55111 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms