Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngr1O55100 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngr1O55100 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms