Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlkO54988 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SlkO54988 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SlkO54988 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SlkO54988 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms