Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TsksO54887 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TsksO54887 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TsksO54887 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TsksO54887 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TsksO54887 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TsksO54887 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TsksO54887 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TsksO54887 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms