Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cavin1O54724 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cavin1O54724 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms