Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lhx8O35652 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms