Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccrl2O35457 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms