Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xbp1O35426 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms