Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms