Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Abcc1O35379 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms