Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna3O35344 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms