Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad6O35182 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms