Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr1aO35134 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms