Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atn1O35126 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atn1O35126 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atn1O35126 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atn1O35126 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atn1O35126 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms