Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn4O35054 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn4O35054 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn4O35054 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn4O35054 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms