Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Casq1O09165 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Casq1O09165 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Casq1O09165 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Casq1O09165 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Casq1O09165 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casq1O09165 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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