Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NumblO08919 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NumblO08919 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NumblO08919 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NumblO08919 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NumblO08919 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms