Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EllO08856 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EllO08856 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EllO08856 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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