Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms