Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec22bO08547 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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