Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8857L7N291 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm8857L7N291 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm8857L7N291 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm8857L7N291 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8857L7N291 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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