Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IfnabL7MTU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms