Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm379J3QQ19 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm379J3QQ19 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Gm379J3QQ19 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm379J3QQ19 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm379J3QQ19 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm379J3QQ19 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm379J3QQ19 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm379J3QQ19 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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