Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms