Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC024978J3QPC3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC024978J3QPC3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms